Se você não quiser, remova-o:
sudo apt-get remove gnome-mag
Provavelmente, existe uma maneira de desativá-lo, mas não consigo ver nada particularmente ruim nisso, já que você não o quer.
Isso provavelmente levará gnome-accessibility com isso, mas, novamente, isso não deve causar nenhum problema. Se você precisar de algo gnome-accessibility instalado (dasher, orca, gok, mousetweaks, etc), você pode marcá-los como uma instalação manual no Synaptic.
Editar: Se você quiser apenas desativá-lo na tela de login (mas usá-lo em outro lugar), desligue-o de um terminal:
sudo -u gdm gconftool-2 /desktop/gnome/applications/at/screen_magnifier_enabled --type bool --set false