Como o Visual Studio é como o NetBeans (faz muita E / S durante a inicialização / trabalho), ele se beneficiaria do SSD. E também, instale os aplicativos que você usa na inicialização. I.E. Antivírus, "Tudo", etc.
Para os arquivos de origem ... isso depende. Se a fonte for muito grande, mantenha-a no HDD secundário. Se couber no SSD, mova-o para lá.
Escolha sabiamente o que você instala ... já que o espaço é muito limitado.
Leia o artigo (verifique a parte inferior): maximizando a vida útil do seu SSD .