takown e isacls são comandos do DOS. Como não há nenhum caminho especificado para alcançá-los no arquivo do Registro, presumo que eles estejam disponíveis no caminho.
Basta criar um arquivo de lote (digamos ownandgrant.bat) contendo
@echo off
takeown /f %1 /r /d y
icacls %1 /grant administrators:F /t
Isso pode causar problemas se o nome do diretório contiver 1 ou mais espaços, por isso, certifique-se de incluir o diretório entre aspas duplas ao chamar o arquivo em lote.
ownandgrant.bat "my special directory"