Não que eu saiba. Infelizmente, o arquivo .trashes armazena a localização do arquivo até que você o apague ou restaure. Você provavelmente não encontrará uma maneira mais fácil de fazer isso além de encontrar os arquivos e apagá-los novamente. Fazer ctrl + z poderia ter resolvido o seu problema no momento em que aconteceu, mas provavelmente é tarde demais para isso.