É possível fazer isso usando o Notepad ++ (como sua tag sugere, mas sua pergunta não especifica explicitamente) usando o modo Expressão Regular na função Substituir. Por exemplo:
- Encontre o que:
<column name="propertys_uid">(.*)</column>
- Substituir por:
<yourreference></yourreference>
- Modo de pesquisa: expressão regular
As expressões regulares do Notepad ++ são em sua maioria compatíveis com PCRE, então você pode ler os PCREs para entender melhor a sintaxe.