Editar: Parece que, se você usar o plug-in do bundler, você precisará usar o bi ou o bundle_install em vez de instalar o pacote, veja os comentários abaixo.
Bem, a julgar pelos erros, eu diria que você não tem permissão para ler ou escrever na pasta git.
Tente:
# chmod -R o+rw .git
Na raiz do seu projeto.