cmd vincula a um arquivo em lotes, ou seja, o arquivo em lote chamado substitui o arquivo em lote de chamada e não retorna, portanto, todas as chamadas após a chamada em lote nunca serão vistas. Se você quiser retornar de um arquivo em lote, use o comando call , como em:
echo %date%, %time%: Deploying web site to Test1. > deploy.bat.log
call Hello.bat
start "" notepad.exe deploy.bat.log
Não é o que você pode esperar, mas uma decisão ruim de design no DOS ainda está conosco, receio. Não tenho certeza de quantos arquivos de lote DOS1 são usados nas versões modernas do Windows, mas posso arriscar um palpite.