Acho que isso tem a ver com a ativação do modo de compatibilidade.
Eu tinha no Windows 7, onde você configurá-lo para ser executado como o Vista SP2 para que você possa minimizar a bandeja. Isso não funciona no Windows 8.
Eu tentei desinstalar, mas lembrei do modo. Tente rodar normalmente e tudo ficará bem, sem a opção minimizar para bandeja.