Este post é semelhante ao seu problema (e com uma resolução aparente).
Em resumo, a edição de com/canonical/unity/interface/cursor-scale-factor no dconf-editor parece persistir no tamanho do cursor.
Estou usando o Ubuntu 16 LTS e instalei o dconf-editor para alterar o tamanho do cursor de 24 para 32. Quando altero a configuração, ela é aplicada imediatamente e posso ver a diferença de tamanho. No entanto, quando eu reiniciar o tamanho foi redefinido para 24 (ou seja, o padrão). Eu tentei várias vezes agora.
Como posso fazer alterações no editor dconf persistentes para reinicialização?
Esta questão foi perguntou neste site há mais de 3 anos por outra pessoa, mas não foi respondida. Eu fiz mv ~/.config/dconf/ ~/.config/dconf.bak para descartar a corrupção.