Sim, este bug está sob controle da NVidia e pode ser corrigido na versão futura dos drivers da NVidia. Eu sugeriria experimentar um destes:
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Desinstale o driver nvidia atual e instale o driver 352.79 conforme sugerido pelo Matlab.
sudo apt-get purge nvidia*
sudo apt-get install nvidia-352
Observe que o driver nvidia-352 pode quebrar sua tela de exibição interna, como é conhecido por algumas máquinas mais recentes.
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Ative a opção software-openGL ao iniciar o Matlab. Você pode fazer isso em um terminal com
%código%
ou faça um atalho na sua área de trabalho com um arquivo chamado Matlab.desktop e preencha com o seguinte conteúdo:
matlab -softwareopengl
Depois de criar o atalho, você precisa fazê-lo digitando o terminal
[Desktop Entry]
Version=9.0
Type=Application
Terminal=true
Exec=matlab -softwareopengl
Name=MATLAB
Icon=/usr/share/icons/hicolor/48x48/apps/matlab.png
Categories=Development;Math;Science
Comment=Scientific computing environment
StartupNotify=true
StartupWMClass=com-mathworks-util-PostVMInit
Agora, se você clicar duas vezes no ícone da área de trabalho, ele deverá funcionar.
Ref: link
Espero que a NVidia corrija este problema na próxima versão do driver!
Atualização em 23 de junho de 2016:
Recentemente, notei que a última atualização do driver NVidia-367 corrigiu esse problema.
Para instalar o driver nvidia-367 no Ubuntu 16.04, você precisa desinstalar o driver nvidia anterior primeiro:
%código%
seguido por uma reinicialização do seu computador.
Em seguida, instale o novo driver adicionando o ppa e recuperando o pacote do repositório.
%código%
Após uma reinicialização bem-sucedida, você verá que o novo driver foi adicionado à sua lista de módulos.
%código%
Fonte: link