O problema que eu experimentei parece estar conectado com a forma como o wubi verifica as imagens ISO disponíveis no diretório raiz de cada sistema de arquivos montado. Ao examinar o arquivo de log que o wubi deixa para trás, descobri que o wubi procura ISOs na pasta raiz de qualquer sistema de arquivos montado, exceto C: \ (assumindo que qualquer outra coisa além de C: provavelmente seja uma unidade óptica contendo um (K / X / L / você-nome-lo) CD do Ubuntu). Havia várias imagens para várias distribuições Linux no meu disco rígido externo e o wubi parece ter resolvido o lubuntu disponível.
Na verdade, o wubi parece ter algum tipo de hierarquia na decisão de qual ISO é aquele a ser mostrado na lista suspensa se houver mais de um disponível (Lubuntu > Ubuntu > Xubuntu [não tentei nenhum outro]).
Mover os ISOs para outro diretório (por exemplo, R: \ isos) corrigiu o problema, agora há o menu suspenso completo dos DEs para escolher.
Espero que isso ajude você, se você tiver o mesmo problema, o que é, reconhecidamente, muito improvável.