Verifique se há aplicativos relacionados à área de transferência na barra de tarefas (mostre ícones ocultos).
No meu caso, Ctrl - X parou de funcionar no Powershell ISE, embora estivesse trabalhando em outros editores. Acabou que era Beyond Compare prancheta comparar corrida. Depois de parar, Ctrl - X começou a funcionar novamente.