Existem muitos métodos. Uma delas é usar um editor de shell como o nano. Supondo que o arquivo seja de propriedade do root, você pode digitar o seguinte:
sudo nano /etc/snort/snort.conf
Contanto que sua conta de usuário seja um administrador, você poderá editar esse arquivo com o sudo. No nano, você deve poder editar seu arquivo com as modificações necessárias. Ctrl-O para salvar e Ctrl-X para sair.