O problema é provável com a ferramenta que você está usando para gravar sua imagem ISO para o pendrive. Isso é difícil de responder sem conhecer a ferramenta que você está usando.
O melhor palpite é que:
A - Você pode estar gravando a imagem ISO em uma partição do pendrive, em vez de todo o próprio dispositivo. O setor de inicialização de um disco ou dispositivo semelhante a disco é o bloco 0, mas as partições começam muito depois. (Como a mídia ótica não tem partições, o sistema operacional não pode atrapalhá-las.) Assumindo o Windows, tente remover qualquer letra ou partição da unidade no dispositivo e aplicar a imagem novamente para garantir que você não esteja selecionando uma partição. / p>
B - Sua ferramenta que você está usando para gravar o dispositivo pode precisar de alguma configuração especial para substituir o setor de inicialização ou semelhante.
Você pode tentar usar dd para windows para gravar o arquivo ISO em "Partition0" do dispositivo que é o pendrive. Este é um utilitário avançado de baixo nível, mas certamente funcionará enquanto o ISO for realmente inicializável.
Seja extremamente cuidadoso com este utilitário - você deve tentar não ter outros dispositivos de armazenamento USB dispositivos conectados ao usar isso e verifique novamente para ter certeza de que está informando dd para usar a unidade certa.
(Experimente o Win32diskimager sugerido por @David Betz primeiro antes de dd ).