Concordo com @Dan Cornilescu. Isso não é uma boa idéia, especialmente considerando o quão temperamental o Linux pode ser quando arquivos / pastas estão sendo manipulados com privilégios do Sudo, ou a falta dele.
Embora eu tenha certeza do que você está sugerindo (apesar do fato de que você nunca fez uma pergunta) é possível, não acho que seja a melhor solução para o problema inicial que você mencionou. "Uma das razões é que eu não quero perder tudo se a caixa virtual falhar ..."
Eu entendo esse problema completamente. Por um lado, você tem um serviço incrível ( grátis ) fornecido pela oracle, mas não quer depender completamente de algo que não seja a "norma". No entanto, existem várias maneiras de neutralizar esse problema que oferecem maior tranquilidade do que "ter todos os arquivos no HD real". Aqui estão alguns recursos integrados ao VirtualBox que eu uso acima de todos os outros.
~ " Instantâneos ." Eles fazem exatamente isso. Crie um instantâneo da VM antes / depois de uma instalação de qualquer tipo ou agende uma captura instantânea com o CronTab. Dessa forma, você sempre tem uma maneira rápida e fácil de carregar / inicializar uma versão anterior antes de uma falha.
~ Um simples exportar / importar da VM (ou .VHD ) conforme necessário. Eu prefiro este método porque é mais estático (para minhas necessidades) do que instantâneos. Ter uma exportação de VHD / VM como backup é essencialmente um computador portátil e / ou um backup interativo. Em vez de uma imagem padrão (dormente) criada por um método proprietário.
~ Crie o seu próprio, ou use uma Caixa Vagrant. Mais informações Aqui e Aqui a>. Você pode encontrar um .box que atenda às suas necessidades e usá-lo como backup ou melhor ainda use um .box básico em conjunto com um script personalizado .SH (BASH). Atualize este script enquanto você instala os progs e altera as configurações para que, em caso de falha, você simplesmente execute um script simples e violä! Você está pronto para sair dos portões de uma nova instalação.