Tenho a impressão de que essas duas coisas são mutuamente exclusivas. Uma intranet é uma rede local que implementa tecnologias da Internet, um VPS é um servidor virtualizado disponibilizado por terceiros através da Internet.
Quer dizer hospedar um site de intranet localmente em uma máquina virtual? Ou talvez usar uma VPN para colocar um VPS remoto no mesmo espaço de endereço da sua intranet?
Em ambos os casos, a resposta é sim. Para o futuro, você precisaria de algo como OpenVPN ou ssh (pointopoint link) conectando o VPS à sua rede. Uma vez que tenha um IP nesse espaço de endereço, você poderia usar o arquivo hosts para mapear isso para um nome resolvível, mas seria uma solução ruim, visto que agora você precisa manter um arquivo hosts por cliente máquina.