O Registro do Windows contém uma lista de todas as associações de arquivos, especificamente a seção "HKEY_CLASSES_ROOT". A exclusão da entrada não corrigirá o problema, já que isso não faz com que ele seja conectado a nada. O que eu acho que você precisa fazer é definir a (s) chave (s) de volta para seus valores originais.
BTW Eu exportei a chave para a chave .MSU do meu computador com Windows 7 Home Premium que ainda deveria estar no valor padrão. Deve ser capaz de colocar isso no Bloco de Notas e salvá-lo com um .REG e depois executá-lo:
Windows Registry Editor Version 5.00
[HKEY_CLASSES_ROOT\.msu]
@="Microsoft.System.Update.1"
[HKEY_CLASSES_ROOT\Microsoft.System.Update.1]
@="Microsoft Update Standalone Package"
"FriendlyTypeName"=hex(2):40,00,22,00,25,00,73,00,79,00,73,00,74,00,65,00,6d,\
00,72,00,6f,00,6f,00,74,00,25,00,5c,00,73,00,79,00,73,00,74,00,65,00,6d,00,\
33,00,32,00,5c,00,77,00,75,00,73,00,61,00,2e,00,65,00,78,00,65,00,22,00,2c,\
00,2d,00,31,00,30,00,32,00,00,00
[HKEY_CLASSES_ROOT\Microsoft.System.Update.1\CurVer]
@="Microsoft.System.Update.1"
[HKEY_CLASSES_ROOT\Microsoft.System.Update.1\DefaultIcon]
@=hex(2):22,00,25,00,73,00,79,00,73,00,74,00,65,00,6d,00,72,00,6f,00,6f,00,74,\
00,25,00,5c,00,73,00,79,00,73,00,74,00,65,00,6d,00,33,00,32,00,5c,00,77,00,\
75,00,73,00,61,00,2e,00,65,00,78,00,65,00,22,00,2c,00,2d,00,31,00,30,00,31,\
00,00,00
[HKEY_CLASSES_ROOT\Microsoft.System.Update.1\shell]
[HKEY_CLASSES_ROOT\Microsoft.System.Update.1\shell\open]
[HKEY_CLASSES_ROOT\Microsoft.System.Update.1\shell\open\command]
@=hex(2):22,00,25,00,73,00,79,00,73,00,74,00,65,00,6d,00,72,00,6f,00,6f,00,74,\
00,25,00,5c,00,73,00,79,00,73,00,74,00,65,00,6d,00,33,00,32,00,5c,00,77,00,\
75,00,73,00,61,00,2e,00,65,00,78,00,65,00,22,00,20,00,22,00,25,00,31,00,22,\
00,20,00,25,00,32,00,20,00,25,00,33,00,20,00,25,00,34,00,20,00,25,00,35,00,\
20,00,25,00,36,00,20,00,25,00,37,00,20,00,25,00,38,00,20,00,25,00,39,00,00,\
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