Você pode conseguir isso usando um pequeno script de shell.
#!/usr/bin/env bash
# go to "root" folder
cd /volume3
# loop over all items in "root" folder
for item in "$( ls )" ;
do
# if it's a folder
if [ -d "$item" ] ; then
# and only contains a single item
if [ "$( ls "$item" | wc -l )" = "1" ] ; then
# move all files in the folder to the "root" folder
mv "$item/"* .
fi
fi
done
(não testado, mas não é um problema, já que pessoas sãs sempre mantêm backups)