O libapache2-mod-php5filter não passa todos os métodos de requisição HTTP para o seu aplicativo PHP - por exemplo, as solicitações PUT e OPTIONS são respondidas diretamente pelo Apache, ao invés de seu aplicativo PHP.
Eu presumo que esteja limitando os métodos que são processados pelo PHP como uma medida de segurança.
libapache2-mod-php5, por outro lado, passa todas as requisições para processamento pelo PHP.
De link , esta mensagem:
"A menos que você precise especificamente do suporte ao módulo de filtro, provavelmente você deve instalar o libapache2-mod-php5"