Eu acho que por padrão versões atuais do padrão mkfs.ext2 / 3/4 para tamanho de inode de 256 bytes (veja /etc/mke2fs.conf). Esse IIRC habilita timestamps de nanossegundos com ext4 e, como você diz, mais atributos estendidos cabem dentro do inode. Tais atributos estendidos são, por exemplo, ACLs, etiquetas SELinux, alguns rótulos específicos do Samba.
Maiores inodes, claro, desperdiçam um pouco de espaço, e à medida que você os torna maiores, você entra em um território de retornos decrescentes muito rapidamente. O padrão de 256 bytes é provavelmente um bom compromisso para a maioria das situações.