De acordo com a página man do tcpdump:
Em sistemas Linux com kernels 2.2 ou posteriores, um argumento de interface de ‘any’ pode ser usado para capturar pacotes de todas as interfaces. Observe que as capturas no dispositivo "qualquer" não serão feitas no modo promíscuo.
Portanto, você deve ser capaz de executar: tcpdump -i any
para capturar dados em todas as interfaces ao mesmo tempo em um único arquivo de captura.