Isso porque existem duas maneiras baseadas em GPO para implantar uma impressora. Você encontrou um deles. O outro:
Configuração do usuário - > Configurações do Windows - > Impressoras implantadas (você precisa do componente Print Services instalado para ver isso.)
É o local em que o MMC de Gerenciamento de Impressão coloca as impressoras implantadas. Ambos os métodos enviarão uma impressora para um cliente, embora usem métodos ligeiramente diferentes para realmente fazer isso acontecer.
POR QUE a Microsoft permitiu dois métodos de implantação? Isso não posso dizer, embora seja provavelmente baseado no fato de que toda a parte "Preferences" de um GPO era um add-on que costumava ser fornecido por uma empresa separada antes que a Microsoft os comprasse e ainda está conosco para razões herdadas.
Uma diferença entre os dois, no entanto. Com o método Preferências, você pode definir uma impressora como a impressora padrão para um usuário. Você não pode fazer isso com o método Configurações do Windows.