Você provavelmente está tendo processos no estado UNINTERRUPTIBLE_SLEEP , normalmente eles estão nesse estado porque estão aguardando algo do hardware, como a leitura de um disco. Esses processos estão efetivamente adormecidos (você tem 244 processos de suspensão), mas eles inserem o cálculo da Média de Carga. Verifique seu servidor de E / S com vmstat e veja se você tem muitos D statuses em top ou ps para confirmar.
EDITAR: Ver sua saída vmstat confirma ainda mais o problema de IO. Sua coluna b em procs mostra uma média de 100 processos em suspensão ininterrupta. Sua coluna bi (blocos lidos de um dispositivo de bloco) é muito alta, assim como a coluna si (memória lida do swap / disco). Finalmente, sob o cabeçalho cpu , a coluna wa mostra que sua CPU gasta mais de 90% esperando que o IO seja concluído.
Você deve verificar por que está tendo problemas com o pedido de inserção. Pode ser a falta de capacidade do servidor, processos em execução selvagem e algumas outras razões, mas é definitivamente IO.