No Server 2016, não há mais uma maneira suportada de mudar para o Core Edition, você precisa decidir qual edição usar no momento da instalação.
Ainda não vi nenhum hacker para fazer isso funcionar, é claro que você pode alterar o shell para cmd.exe
ou powershell.exe
, mas eu não recomendaria a remoção manual de arquivos e a alteração do registro.
Portanto, no seu caso, eu tenho medo que você tenha que esperar até que os ISOs estejam disponíveis no MSDN.