O 32 Gig deve ser mais do que suficiente para uma instalação do wubi com um pequeno diretório pessoal. Se você precisar de muito mais, provavelmente deve fazer uma instalação completa do Ubuntu, não do wubi.
Como você disse que o espaço em disco está baixo devido às atualizações, talvez você queira tentar executar sudo apt-get clean; sudo apt-get autoremove
, o que removerá arquivos de atualização de arquivos antigos e programas que foram instalados automaticamente, mas não são mais necessários.