O servidor precisa ser reinicializado para concluir o patch dos arquivos que estavam em uso durante o processo de correção, deixando sua máquina em um estado inconsistente (ou seja, instalando atualizações e permitindo que seja executada). .
O primeiro antes de você corrigir como um bom nível conhecido de atualizações da Microsoft.
O segundo estado é a sua máquina executando o último conjunto de patches da Microsoft.
O que você está criando é um terceiro estado onde alguns arquivos são atualizados, enquanto outros não são, a questão não é que você está mais em risco (porque a resposta parece ser um óbvio sim), quais etapas você tomaria se o seu máquina foi comprometida durante este estado inconsistente? Eu imagino que a Microsoft diria a você o que eles me disseram no passado: 'Oh, querida, eu sinto muito, reconstrua sua máquina, ela não estava em uma configuração que nós apoiamos'
Se você estiver corrigindo sua máquina, faça isso em um único hit, aplique os patches e imediatamente reinicie-o - mesmo que isso signifique ficar fora de horas para fazê-lo. Se o seu aplicativo é tão crítico que você não pode gerenciar uma interrupção de 5 minutos de reinicialização, então você deve estar olhando para estender sua infra-estrutura para lidar com isso (ou seja, vários servidores de carga balanceada).