@Iain comentou que se tratava de uma verificação automatizada, e não tenho certeza se estou certo ou errado, mas acho que vale a pena ser cuidadoso, pois o site está nuking e a reconstrução é um problema. um pouco trabalhoso se isso é apenas uma varredura.
Primeiro, você tem backups? Nesse caso, você pode tentar comparar o conteúdo de seu backup / sbin e / bin e de outros diretórios com o ambiente de produção para encontrar alterações.
Você tem verificadores de integridade de arquivos instalados? É inútil depois do fato de ter sido hackeado, mas se você não tiver, considere instalar um sistema como o tripwire ou o samhain. Configurados corretamente, eles podem enviar alertas por e-mail quando os arquivos são alterados ou há atividades suspeitas. (NOTA - isso requer manutenção. Quando você faz atualizações no sistema, atualize seus bancos de dados de acordo)
Verifique o sistema com chkrootkit e rkhunter.
Monitore seu sistema para atividades de rede incomuns. Use programas como ntop; obtenha estatísticas sobre o comportamento "normal" do seu sistema para saber quando algo não está certo ou deve ser analisado. Verifique se há portas abertas incomuns.
Analise seu sistema com o clamscan para ver se isso trava qualquer sinal usualmente de malware.
E se você não tiver backups ... comece a criá-los!
Por enquanto eu procuraria o comportamento semelhante que você vê nos logs e veria se outros postaram sobre ele e descobriu que era apenas uma varredura. Se o seu sistema não está atuando engraçado e as ferramentas de varredura de malware não estão encontrando nada provavelmente não precisa se preocupar (embora se ele tenha sido hackeado, o paranóico resposta é não confiar em seus binários ...). Se você instalou através de uma distro que usa um empacotador, pode ser possível verificar seus binários em relação ao empacotador para garantir que tudo corresponda ... se as somas de verificação coincidirem, você deve ser bom.