O ext4 é um sistema de arquivos com registro de datas, o que significa que, se o dispositivo for desconectado prematuramente, há mais chances de recuperar o sistema de arquivos danificado. A parte do diário da gravação contém informações sobre o que está prestes a ser feito e ele é limpo após a conclusão da operação. Se for descoberto que há um diário incompleto em um dispositivo quando ele é montado, o sistema de arquivos pode ser revertido para seu estado anterior, preservando assim sua integridade.
Embora exista alguma sobrecarga extra em termos de espaço envolvido em ter um sistema de arquivos journalling em um pendrive, é realmente uma boa escolha para a maioria das coisas.
Obviamente, se você precisar de um dispositivo que também possa ser conectado a qualquer computador a qualquer momento, o FAT seria o caminho a seguir. Se você quiser um dispositivo que precise ser conectado a um computador Windows apenas ocasionalmente, é possível instalar drivers de dispositivo ext2 no Windows que permitirão a leitura de todas as unidades ext (x). É claro que, como o Windows não sabe sobre as permissões e a propriedade do Linux, elas também não serão tratadas.