Sim, você precisa atualizar as estatísticas manualmente, especialmente à medida que seu banco de dados aumenta.
A lógica de estatísticas auto_update entra em ação somente depois que a tabela cresceu 20% a partir da última vez em que as estatísticas foram atualizadas. Em tabelas maiores, isso pode ser centenas de milhões de registros. Nesses casos, as estatísticas ficarão desatualizadas antes que a lógica de atualização automática seja acionada, portanto, será necessário atualizá-las manualmente.
Agora, se você reconstruir seus índices regularmente, as estatísticas do índice já serão atualizadas, pois isso é feito como parte do processo de reconstrução do índice. Se você desfragmentar seus índices em vez de reconstruí-los, será necessário atualizar as estatísticas, pois a atualização das estatísticas não é feita automaticamente quando você desfragmentar o índice.