Você precisa iniciar um processo de eliminação - o Windows faz muitas coisas enquanto a tela "Bem-vindo" está girando, mas a boa notícia é que a maioria dos problemas será registrada no log de eventos.
Veja o tipo de coisas que eu estaria fazendo:
- Ainda será feito se o usuário não tiver nenhum perfil móvel configurado?
- Será que ainda será feito se nenhuma política de grupo for aplicada ao usuário e à estação?
- Demora muito tempo para um usuário local fazer logon? Como sobre o administrador local?
- Demora muito tempo para fazer logon usando um perfil em cache (por exemplo, com o cabo de rede desconectado?)
Espero que, ao fazer o acima, você possa começar a eliminar certas causas e refinar sua investigação. Aqui está um excelente artigo de Mark Russinovich sobre alguns diagnósticos de baixo nível: