Tenho certeza de que os computadores System76 funcionarão bem com o Windows. As partes em seus computadores são bastante padrão parece. Existem até guias para instalar o Windows junto com o Ubuntu nessas máquinas: link
Também há drivers para Windows fornecidos aqui: link
O Windows 7/8 funcionaria da maneira mais proativa, como em qualquer outra máquina. Não vejo razão para isso não se comportar como você quer.