Isso varia muito dependendo do que você planeja usar a máquina. No entanto, isso não seria uma resposta muito útil. Então:
Usar o particionamento guiado é bom para usar um PC de mesa. Isso colocará tudo em uma partição para que você não gaste espaço em disco em uma partição, a menos que fique sem espaço em disco.
Eu prefiro colocar / home em sua própria partição para que você possa substituir o sistema operacional sem ter que restaurar seu diretório inicial. Nesse cenário, atribua 10GB à partição / (root), para que você não precise se preocupar com a falta de espaço em disco para a instalação de aplicativos.
Para um servidor de arquivos, servidor de backup para um pequeno escritório, onde você tem vários usuários, uma configuração similar é adequada, embora eu coloque os backups em / home / backup / em seu próprio disco.
Servidores da Web com bancos de dados ou servidores de e-mail devem ter um diretório / tmp separado, o tamanho pode variar, mas algo como 3 GB geralmente é adequado. Ter um diretório / tmp separado permite que você o monte com noexec por um pouco de segurança extra. Ele também impede que as filas de e-mail ou consultas de banco de dados utilizem todo o espaço em disco, pois há um limite rígido, pois os arquivos não podem crescer mais do que essa partição.
Para o servidor, você geralmente não tem aplicativos GUI, portanto, a partição / (root) pode ter 3 GB.
Você também deve ter um diretório / var / separado para os servidores, a fim de evitar que arquivos de log, arquivos de spool etc. cresçam muito e consumindo todo o espaço em disco. Eu sugiro que cerca de 5GB seja razoável.
Se você precisar de uma partição / boot separada, 100MB é adequado.
Você pode usar o LVM para dar a você a capacidade de redimensionar partições mais tarde.
Em conclusão, depende inteiramente do que você vai usar a máquina, se em dúvida colocar tudo em uma partição. Se você não puder pagar o tempo de inatividade, use o LVM para redimensionar mais tarde.