Parece que você está executando um kernel de 64 bits. Você não precisa instalar um kernel PAE.
Originalmente tive uma resposta aqui explicando como instalar o kernel do PAE porque de início eu perdi o fato de que você tem um kernel de 64 bits.
A minha interpretação (muito limitada) do mapa de RAM física fornecido pela BIOS é que a sua BIOS está apenas a dizer ao seu SO cerca de 3480223744 bits endereçáveis, ou seja, cerca de 3,2 GB. Se você subtrair os bits reservados, ficamos com 3,1 GB.
Algumas pessoas relataram a leitura do seguinte em sua saída do dmesg:
WARNING: BIOS bug: CPU MTRRs don't cover all of memory, losing 13040MB of RAM
Você poderia executar dmesg | grep -i memory
e procurar uma mensagem de aviso semelhante?