Você poderia inicializar um disco Linux em ambas as máquinas e usar o dd sobre secure shell, que lhe dará uma cópia em disco, desde que as unidades de disco correspondam. Se eles não são os mesmos drives, você pode ter alguns problemas com o novo sistema. Às vezes, eles podem ser corrigidos com o Testdisk e / ou o reparo do Windows posteriormente.
Você tem que ter muito cuidado para prestar atenção aos parâmetros que você passa (assim você não sobrescreve o seu volume de servidor "bom"). Enquanto você for cuidadoso, o pior que fará será perder o tempo necessário para copiar o volume pela rede para ver se isso funcionará.