Você pode até usar o usuário OD normal criado para uso de AFP e SMB fora da caixa, sem qualquer alteração nos esquemas de OD. Você só precisa compensar o caminho do diretório inicial um pouco incomum listado no OD. Quando você usa pastas domésticas conectadas em rede para clientes AFP com um compartilhamento no servidor OS X, ele se parece com
/Network/Servers/servername/Users/username
Para que os diretórios home do usuário funcionem nesse caso, você precisa montar o compartilhamento de NFS em casa para /Network/Servers/servername/Users ou criar um symlink para o diretório /home neste local.
Uma desvantagem dessa abordagem fácil é que você precisa do Kerberos para alterar as senhas do lado do Linux se elas precisarem ser mantidas em sincronia com o lado da Apple, já que a operação normal de alteração de senha LDAP não estará funcionando.
O homedir e os problemas de senha são irrelevantes se você tiver uma base de usuários separada para os clientes Linux.