Eu não consegui estabelecer o que exatamente o pacote ndn-php5-cgi é ou faz, mas é certamente a razão pela qual o php-pear não é instalado. Remova o pacote completamente ou certifique-se de que o instalador do debian pode sobrescrever o arquivo /etc/pear/pear.conf. Provavelmente, também é uma boa ideia fazer uma cópia de backup desse arquivo para que você possa descobrir se esses dois pacotes podem realmente viver lado a lado.