Uma grande e gritante ressalva é que o agente VMware provavelmente não estará ciente dos bancos de dados de troca, portanto, os logs não serão truncados. Se você está confortável com o log circular, isso deve ser ok.
Editar: Veja os comentários abaixo; Não é uma boa ideia depender apenas do agente VMware. O produto VMware Data Recovery da VMware usa as mesmas APIs ("VADP") para backup como o Backup Exec 2010, e aqui está a recomendação da VMware sobre o assunto:
While VDR can use the VSS framework to back up Windows guest OS virtual machines it does not contain the required Exchange VSS requestor to properly back up and restore an Exchange mailbox database.
( fonte )