A última vez que experimentei o WPI, ele forçou a instalação do prereq.
Sugiro simplesmente manter seu mysql e fazer o upload do pacote wordpress para fazer a instalação, é fácil de fazer, você descompacta o arquivo e executa um script. O script de instalação pedirá as informações de login da instância mysql.
Apenas certifique-se de fazer o diretório do wordpress no IIS aberto escrever temporariamente para permitir que o script funcione.
O WPI é bom em algumas instâncias, mas você não pode saber o que fazer em segundo plano, para proteger um servidor da Web, eu odeio isso.
Certifique-se de que o PHP funciona antes de instalar o wordpress, pois é um pré-requisito.