Os avisos mod_wsgi estão notificando você sobre um possível problema de dependência. Embora seja improvável que seja um problema (não é comum haver diferenças significativas na API entre um release x.y.z e x.y.z + 1) ele não sabe disso com certeza, portanto, avisa que há um problema em potencial. A única maneira de classificar isso é recompilar o módulo em relação à versão mais recente, e se você estiver usando os pacotes padrão, precisará aguardar que os mantenedores do pacote façam isso. Se você tiver compilado o Apache (ou apenas aquele módulo), então você pode fazer a recompilação (você também pode até mesmo se estiver usando os pacotes padrões da distro, mas eu não recomendaria isso para um problema tão pequeno).
O aviso "apache has started" entrou nos logs de erro por algum tempo. IIRC. Em muitos ambientes, a reinicialização é um problema que pode causar tempo de inatividade, portanto, é válido estar lá como uma mensagem de "aviso" para que os scanners de registro automatizados recebam e relatem se acontecer fora de uma janela de manutenção planejada.