As maiores diferenças que você verá são o gerenciador de pacotes e a idade do pacote.
Arquivos de configuração para o apache, mysql / postgresql, php, etc. estarão em praticamente o mesmo lugar, e tão fáceis de encontrar em qualquer distro. Não há customização louca nos arquivos de configuração do Ubuntu / Debian ou do CentOS para essas coisas.
O que será diferente ..
Gerentes de pacotes: Ubuntu & O Debian usa apt-get e dpkg. O CentOS / RHEL usa yum e rpm.
Idade do pacote: O Ubuntu vai ter os pacotes mais novos. Os administradores de sistemas avessos a riscos muitas vezes o evitam por esse motivo.
O CentOS / RHEL tem pacotes mais antigos, mas muito sólidos. Nunca sangrar, mas raramente mofado.
O Debian terá pacotes realmente antigos. Sysadmins avessos ao risco muitas vezes adoram, porque é realmente estável.
Mesmo se os tutoriais do ubuntu forem para uma versão diferente de um pacote que você esteja usando, você ainda deve ser capaz de segui-lo, lembrando-se de substituir "apt-get install php" por "yum install php", e coisas assim.