Você tem 4 alternativas declaradas para editor , correspondendo às linhas numeradas de 1 a 4. A linha numerada 0 sempre lista a alternativa com a prioridade mais alta, que é a que update-alternatives --auto definiria.
Se você selecionar 0 neste menu, isso colocará a alternativa no modo automático, portanto, se uma alternativa de prioridade mais alta aparecer, ela será selecionada. Se você selecionar 4, então /usr/local/bin/vim permanecerá selecionado, independentemente do que você instalar.
A entrada para /usr/local/bin/vim deve ter sido declarada manualmente, já que nenhum pacote do Ubuntu inclui nada sob /usr/local . Se você quiser removê-lo da seleção, execute sudo update-alternatives --remove editor /usr/local/bin/vim ; o grupo retornará ao modo automático (assim, /bin/nano será escolhido como 0 e selecionado).