Ok, tenho certeza de que não é possível para o Ubuntu causar problemas de hardware no Windows, mas ...
Instalei o 12.04 como uma inicialização dupla em um Compaq Presario CQ61 com o Windows 7 Home Premium. Instalar correu perfeitamente e dual boot funciona bem. Como muitas outras pessoas, notei que minha máquina ficou muito quente ao usar o Ubuntu. Parte estranha é agora também parece estar mais quente quando estou no Windows. O senso comum e o pouco que eu sei sobre computadores me dizem que não poderia haver uma conexão, mas quero verificar com a comunidade apenas no caso.
Obrigado antecipadamente.
Mas, se você reiniciar no Windows logo após o Ubuntu, as coisas podem parecer mais quentes, enquanto o calor "extra" se dissipa. Isso deve desaparecer se você "reinicializar" o Windows depois que o computador estiver desligado por pelo menos uma hora.
Escusado será dizer que a reinicialização direta não vai prejudicar o seu computador (embora seu colo possa parecer mais quente;)