Você começa inicializando o ClutterGtk, depois o GstClutter, ambos com o sys.argv, então tudo deve funcionar bem.
Veja o código de inicialização do público, por exemplo: link (não tenho certeza se o X.init_threads é realmente necessário, mas houve alguns problemas estranhos no Audience que foram (provavelmente) resolvidos com isso)