Supondo que você quer dizer 'chave secreta ssl', então não, você não pode realmente adicionar a senha de uma chave para os scripts inits. Em vez disso, você não deve armazenar a chave em formato criptografado se quiser iniciar o serviço automaticamente. Para converter um arquivo de chaves em formato não criptografado, você pode usar o openssl:
openssl rsa -in foo.key -out foo_unencrypted.key