Para convertê-los em myisam você executaria
ALTER TABLE searchcore ENGINE=MyISAM;
ALTER TABLE searchgroup ENGINE=MyISAM;
ALTER TABLE searchlog ENGINE=MyISAM;
ALTER TABLE tagcontent ENGINE=MyISAM;
Dito isto, a sobrecarga que você está vendo é totalmente normal com o innodb. Ele aloca em partes e, portanto, haverá sobrecarga para o próximo limite de partes. Não é um problema.