Ter seu próprio formulário de login personalizado iria impedir o uso do Shibboleth. Ele é destinado a enviar seus usuários para o IdP, que eles podem reconhecer como confiáveis e autenticar lá, apenas para delegar as declarações de autenticação e autorização ao provedor de serviços.
Se você não estiver satisfeito com a aparência da sua federação WAYF ou do IdP da instituição, fale com sua federação ou com seu IdP.
(Como uma observação, a identidade visual e a aparência dos WAYFs e IdPs para melhorar a experiência do usuário foi um dos tópicos abordados no Federated Management (FAM10) conferência : provavelmente haverá novas coisas vindo na federação do Reino Unido, se você é parte dela.)