Eu tive um problema semelhante que foi respondido em O Dropbox desaparece dos Aplicativos de Inicialização após a reinicialização no Ubuntu 16.04 . Você pode tentar a resposta fornecida por @JacobVlijm.
Basta renomear o arquivo ~ / .config / autostart / dropbox.desktop para (por exemplo)
start_dropbox.desktopdepois de criado, e o Dropbox não o reconhecerá como seu e deixará o arquivo sozinho.
Em outras palavras, quando você adiciona uma entrada a Startup Applications , um arquivo .desktop correspondente é criado na sua pasta ~/.config (uma pasta oculta encontrada em Home digitando Ctrl + H para mostrar arquivos ocultos e pastas). O que funcionou no meu caso foi renomear o arquivo criado lá com qualquer coisa (no meu caso, alterá-lo de nameofapplication.desktop para start_nameofapplication.desktop ).