Sim, você pode instalar e executar as duas coisas ao mesmo tempo. Sem problemas. Eu consegui executar aplicativos de desktop remotos independentemente dos aplicativos Citrix do mesmo servidor.
Se você receber uma mensagem de erro sobre "O aplicativo inicial que você está tentando abrir não está disponível no momento" ao tentar abrir um RemoteApp, talvez seja necessário ativar o " Lançamento de programas não publicados " na seção Políticas do Usuário Citrix do AppCenter