Quando você instala um software que você instala e as dependências de que ele precisa, estes são outros softwares e bibliotecas que ele precisa para executar, mas quando você o remove, você apenas remove o software que você instalou.
Você pode remover as dependências (assumindo que elas não são necessárias por outra coisa) com:
sudo apt-get autoremove
Ou em uma etapa com a remoção da embalagem original:
sudo apt-get autoremove ndiswrapper