Mesa é a biblioteca GL usada. O Ubuntu 16.04 inclui o Mesa 11.2, que suporta o OpenGL 4.1. Basta instalar os pacotes libgl1-mesa-dev
e mesa-common-dev
para instalar os arquivos de desenvolvimento para ele.
Se você realmente precisa do 4.5, provavelmente precisará desenvolver-se contra os drivers AMD ou NVidia propreitários, e precisará de um cartão que realmente suporte o 4.5 para executar qualquer software que você criar usando essa versão da API.